Das Süddeutsche Institut für empirische Sozialforschung e.V. wurde von den vier Soziologinnen Dr. Kerstin Dressel, Sylvia Lustig, Astrid Manstetten und Prof. Dr. Patricia Pfeil 1999 in München gegründet.
Nach einem Wechsel im Jahr 2003 wird das Institut seither von Dr. Kerstin Dressel, Dr. Marion Müller, Prof. Dr. Patricia Pfeil und Dipl.-Soz. Lisa Donath geleitet. Dasselbe Team gründete 2010 auch die gemeinnützige SINE-Institut GmbH.